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Se você está à procura de um utilitário de software que podem ajudar no alinhamento de grandes conjuntos de curtas sequências de DNA para grandes genomas, a gravata borboleta é pelo menos vale a pena tentar.

O que os cenários em que uma gravata borboleta comprova sua relevância no mercado têm em comum é o produto da capacidade de resposta ao tratamento de conjuntos de curto lê, onde pelo menos um válido alinhamento é incluído na maioria das leituras; quando as leituras são de alta qualidade; bem como quando há um pequeno número de alinhamentos, relatado por leituras.

A ferramenta de baixo consumo de memória pode ser explicado pelo fato de que ele depende de um Burrows-Wheeler índice de manipular o genoma, com a possibilidade de empregar vários processadores ao mesmo tempo, a fim de obter avançado de alinhamento de velocidade.

Deve ser observado que, em circunstâncias normais, a taxa na qual ele é capaz de alinhar 35 pares de base leituras de o genoma humano é de 25 milhões de leituras por hora, com lcolorspace, espaçada, e emparelhados-final modos de alinhamento a ser suportados.

Além do que, você deve saber que SAM está entre os formatos de arquivo suportados por uma gravata borboleta, que traduz para o fato de que o software utilitário pode realizar tarefas que exijam esforços de colaboração com o SAMtools consenso, indel chamadores e SNP.

Vale destacar que a gravata borboleta é um pedaço de software que os usuários podem interagir por meio de linhas de comando, de modo que algumas habilidades técnicas são necessárias.